في هذه المرحلة يتم تخصص الخلايا لتكوين الأجهزة والأعضاء التي لم تكن موجودة من قبل، وتبدأ هذه المرحلة من بداية الأسبوع الثالث، ويمر الحميل في هذه المرحلة بعدد من الأطوار الفرعية المتمايزة وهي:

أ) طور العلقة:

يبدأ هذا الطور في اليوم الخامس عشر وينتهي في اليوم الثالث والعشرين أو الرابع والعشرين ويتكامل في شكل علقة بالتدريج، والعلقة في اللغة العربية تأتي للمعاني الآتية:

1)دودة صغيرة تعيش في البرك وتمتص دماء كائنات أخرى.

2)شيء متعلق في غيره.

وهذان المعنيان يتحققان في شكل الجنين الإنساني الذي يبدو في شكل يشبه العلقة (الدودة) التي تعيش في الماء تماماً ويتعلق في جدار الرحم بحبل السرة.

وهذان المعنيان للفظ: علقة؛ يصفان المظهر الخارجي لطور الجنين وصفاً دقيقاً ومعبراً.

3)ويأتي لفظ علقة بمعنى الدم المتخثر أو المتجمد.

وهذا المعنى للفظ علقة يصف أبرز تركيب داخلي يؤثر على المظهر الخارجي: ففي مرحلة العلقة تتكون الدماء في داخل الأوعية الدموية في شكل جزر مغلقة، تجعل الدم جامداً غير متحرك في الأوعية الدموية معطياً إياها مظهر الدم المتجمد وقد جاء ذكر هذا الطور في القرآن الكريم بعد ذكر مرحلة النطفة فقال تعالى: {ثُمَّ خَلَقْنَا النُّطْفَةَ عَلَقَةً} سورة المؤمنون: آية 14.

ب) طور المضغة:

يتحول الحميل من صورة العلقة إلى بداية صورة المضغة ابتداء من اليوم الرابع والعشرين إلى السادس والعشرين، وهي فترة وجيزة إذا قورنت بفترة تحول النطفة إلى علقة.

وكلمة مضغة معناها:

1)المادة التي لاكتها الأسنان ومضغتها.

2)قدر ما يمضغ.

3)مضغ الأمور: أي صغارها.