أما التركيب التشريحي والداخلي للكلية فإنها من بدائع صنع الله وخلقه حيث تحاط الكلية من الخارج بالقشرة (Cortex) المحتوية على أجسام صغيرة كروية الشكل تظهر كالحبيبات تسمى كريات ملبيجي (Malpghiam corpusles) تصل عددها إلى حوالي مليون يخرج منها أنابيب تسمى بالأنابيب الكلوية (Renal tubules) توصل كريات ملبيجي بحوض الكلية (Renal pelvis) .

وتنقسم تلك الأنابيب الكلوية في منطق القشرة إلى:

الأنابيب الملتفة القريبة (proximal convoluted tubules) والأنابيب الملتفة البعيدة (distal convoluted tubules) .

ويلي القشرة منطقة النخاع (Medulla) وهي المنطقة الوسطى في الكلية ، وتظهر فيها خطوط طفيفة مستقيمة هي الأنيبات الجامعة (collecting tubules) تنتهي على شكل هرمي يسمى بأهرامات ملبيجي (Pyramids of Malpighi) تفتح في نهايتها الأنيبات الجامعة.

ويلي النخاع للداخل حوض الكلية (Pelvis) وهو المنطقة الداخلية من الكلية، وهو تجويف متسع تصب فيه الأنيبات الجامعة قطرات البول، ومن هذا التجويف يحمل الحالب البول إلى المثانة حيث يخزن إلى وقت إخراجه والتخلص منه.

وتحتوي الكلية حوالي مليون وحدة فسيولوجية تسمى بالنفرون (Nephron) وإذا فردنا نفرونات كل كلية يصل طولها إلى 380 متر يدور فيها الدم لاستخلاص البول والمواد الأخرى منه.

صورة توضيحية لآلية عمل النفرون فتأمل خلق الله سبحانه وتعالى

ويتكون كل نفرون من جزء متضخم يسمى محفظة يومان (Bowmans capsule) يحيط بكمية متجمعة غزيرة من الشعيرات الدموية تسمى بالكلبة أو الجمع (Glomerulus) ويسمى الجمع والمحفظة بكرية ملبيجي (Malpighian corpuscle) تخرج من كرية ملبيجي أنبوبة دقيقة هي الأنيبة البولية (uriniferous tubule) توصل كريات ملبيجي بحوض الكلية وتنقسم الأنيبة البولية الواحدة إلى الأجزاء التالية: