ولكل نبات من النباتات النامية والحية مجموعة من الكائنات الحية الدقيقة - وخاصة الفطريات - تعيش في محيطه الجذري في منطقة تسمى الجذر محيطية أو المحيط الجذري (Rhizosphere) أو توجد على سطح الجذر وتسمى (Rhizoplane) وهي المسئولة عن العديد من الأمراض الفطرية التي تصيب النباتات الزهرية، ومسئولة أيضا عن خصوبة التربة والإنتاج النباتي المرتفع لبعض النباتات.
وتقسم الفطريات في التربية بحسب تقسيم برجي (Burges) سنة 1958م إلى:
-المتطفلات الإجبارية (Oblig ate parasites) : وهي تتطفل إجباريا على النباتات والحيوانات في التربة، وتعمل على موت النبات والحيوان وتحللهما، وإضافة محتواهما العضوي إلى التربة وزيادة خصوبتها.
-المتطفلات الإختيارية: (Facultative parasites) : وهي الفطريات التي تتطفل على عائلها في وجوده وتتحول إلى التغذية الرمية في غيابه.
-فطريات التربة الحقيقية (True soil fungi) : وهي تقوم بدور مهم في التربة من حيث هدم أجسام الحيوان والنبات ومخلفاتهما في التربة، وإتمام العديد من الدورات الحيوية فيها، وقد فصلنا ذلك في موضوع (وما تحت الثرى) في كتابنا (آيات معجزات من القرآن الكريم وعالم النبات) .