كانت هذه المرحلة في خلافة عثمان بن عفان رضي الله عنه وكان حافظًا للقرآن كله كما ورد في الروايات الصحيحة. والسبب الرئيسى في اللجوء إلى هذا الجمع في هذه المرحلة هو اختلاف الناس وتعصبهم لبعض القراءات، إلى حد الافتخار بقراءة على قراءة أخرى، وشيوع بعض القراءات غير الصحيحة.

وهذا ما حمل حذيفة بن اليمان على أن يفزع إلى أمير المؤمنين عثمان ابن عفان، ويهيب به أن يدرك الأمة قبل أن تتفرق حول القرآن كما تفرق اليهود والنصارى حول أسفارهم المقدسة. فنهض رضي الله عنه للقيام بجمع القرآن في"مصحف"يجمع الناس حول أداء واحد متضمنًا الصلاحية للقراءات الأخرى الصحيحة، وندب لهذه المهمة الجليلة رجلاً من الأنصار (زيد بن ثابت) وثلاثة من قريش: عبد الله بن الزبير، سعد بن أبي وقاص، وعبد الرحمن بن الحارث بن هشام. وزيد بن ثابت هذا كان هو رئيس الفريق الذي ندبه عثمان رضي الله عنه لهذه المهمة الجليلة؛ لأنه أي زيد بن ثابت قد تحققت فيه مؤهلات أربعة للقيام بهذه المسئولية وهي:

كان من كتبة الوحي في الفترة المدنية.

كان حافظًا متقنًا للقرآن سماعًا مباشرًا من فم رسول الله.

كان هو الوحيد الذي حضر العرضة الأخيرة للقرآن من النبي عليه الصلاة والسلام على جبريل عليه السلام.

كان هو الذي جمع القرآن في خلافة أبي بكر رضي الله عنه.

منهج الجمع في هذه المرحلة

وقد تم الجمع في هذه المرحلة على منهج دقيق وحكيم للغاية قوامه أمران:

الأول: المصحف الذي تم تنسيقه في خلافة أبي بكر رضي الله عنه، وقد تقدم أن مكوّنات هذا المصحف هي الوثائق الخطية التي سجلها كتبة الوحي في حضرة النبي عليه صلى الله عليه وسلم سماعًا مباشرًا منه.

فكان لا يُقبل شيء في مرحلة الجمع الثاني ليس له وجود في تلك الوثائق التي أقرها النبي عليه الصلاة والسلام.

الثاني: أن تكون الآية أو الآيات محفوظة حفظًا مطابقًا لما في مصحف أبي بكر عند رجلين من أصحاب رسول الله صلى الله عليه وسلم على الأقل. فلا يكفى حفظ الرجل الواحد، ولا يكفى وجودها في مصحف أبي بكر، بل لابد من الأمرين معًا:

1 -وجودها في مصحف أبي بكر.

2 -ثم سماعها من حافظين، أي شاهدين، وقد استثنى من هذا الشرط أبو خزيمة الأنصارى، حيث قام حفظه مقام حفظ رجلين في آية واحدة لم توجد محفوظة إلا عند أبي خزيمة، وذلك لأن رسول الله صلى الله عليه وسلم جعل شهادته بشهادة رجلين عدلين.