وثانيهما: تطبيق كثير مما ورد بالنسبة إلى تلك الأُمم وإلى إطاعتهم وإلى معصيتهم وما ورد عليهم من الشر والنقم والخير والنعم وغير ذلك على طوائف هذه الأُمة فيما صدر منهم بالنسبة إلى إطاعة النبي والأئمة فِي أمر الولاية وعدمها، وما ورد ويرد عليهم من الشر والخير لذلك، وذلك بتمثيل الأخيار بالأخيار، والأشرار بالأشرار، وتبيان وجه الشبه فِي تنظيم أفعالهم بأفعالهم، كتنظير أصحاب السبت بقتله ذُرِّية النبي كبنى أُمية وبنى العباس مثلاً، وأصحاب الكهف بأبى طالب ونظرائه مثلا، وأصحاب العِجْل بأهل السقيفة ... وغير ذلك (ص 235) .
والفائدة الثانية: بيَّن فيها أن المراد فِي الباطن بجميع ما حرَّم الله فِي القرآن: أئمة الجور، وبما أحلّ: أئمة الحق، وأنهم أصل كل خير، فروعهم كل بر، وأعداؤهم أصل كل شر، ومن فروعهم كل قبيح وفاحشة، وأن أعداءهم المراد بالفواحش والمناهى وما يُعبد من دون الله (ص 236) .
والفائدة الثالثة: قال فيها:"إنه تقدَّم وجوب الإيمان بظاهر القرآن وباطنه معاً، وأن كُلاً منهما مقصود البارى، ولكن لما كانت التفاسير المتداولة مشتملة على جُلِّ ما يتعلق بالظاهر، وكان مقصدنا بالذات من وضع هذا الكتاب إبراز خبايا التأويلات المستفادة من الأئمة السادة، لخلو أكثر التفاسير عنها جميعاً، ومن أكثرها، جعلنا مدار كلامنا على تبيين هذا الأمر وبيان ما يتعلق بالبطون فلا نتعرض لما يتعلق بالظواهر مفصَّلاً، حذراً من التطويل والخروج عن المقصود الأصلى (ص 236) . والفائدة الرابعة: بيَّن فيها أن كل ما ذكره من تأويل الآيات والكلمات القرآنية فِي تفسيره، فمبناه على التجوُّز فِي المعنى، أو الإسناد، أو نحو ذلك من وجوه الاستعارات وأمثالها. قال: ومع هذا لا يجوز ذلك فِي موضع إلابعد وجدان مستند له فيه وفى مثله، أو بحسب العموم والإطلاق الشامل (ص 236) ."