ـ المقدمة في المسألة الشرقية منذ نشأتها إلى الربع الثاني من القرن الثامن عشر (محاضرة ألقاها أيضًا في دار الجمعيات العلمية في باريس سنة 1897، وظهرت في كتاب في مدينة القدس) .
ـ تاريخ علم الأدب عند الإفرنج والعرب وفيكتور هيغو (صدرت الطبعة الأولى منه سنة(1904) في القاهرة تحت هذا العنوان واسم المؤلف هو المقدسي، ثم أعيد طبعه مرة ثانية سنة 1912 في مطابع مجلة الهلال المصرية ووضع اسم المؤلف الصريح: روحي الخالدي ويعود سبب توقيع الخالدي باسم المقدسي إلى خوفه من الاستبداد العثماني لأنه كان من المنادين بالحرية والاستقلال عن الدولة العثمانية.
ـ الانقلاب العثماني وتركيا الفتاة (مقالتان، نشرت الأولى في مجلة الهلال سنة 1908 بتوقيع المقدسي للأسباب التي ذكرناها سابقًا، والثانية نشرت في العدد التالي من مجلة الهلال للعام نفسه، لكن هذه المرة بالاسم الصريح، وقد طبعتهما دار الهلال في كتاب مستقل سنة 1909.
ـ الكيمياء عند العرب ـ دار المعارف بمصر ـ سنة 1953
ـ رحلة إلى الأندلس ـ بلا تاريخ ـ بلا مكان للطبع.
وهناك مخطوطات ما تزال تنتظر الطباعة، منها:
ـ علم الألسنة أو مقابلة اللغات
ـ الصهيونية (كتاب غير مكتمل)
ـ تاريخ الأمة الإسرائيلية وعلاقتها بالعرب وغيرهم من الأمم
ـ تراجم أعلام الأسرة الخالدية (غير مكتمل)
ـ برتلو: العالم الكيماوي ـ الهلال ـ 1902
ـ حكمة التاريخ ـ جريدة طرابلس الشام 1903 (وقد أدّت هذه المقالة إلى تعطيل الجريدة ووقفها عن الصدور)
وهناك مراجع تشير إلى وجود كتاب مطبوع للخالدي تحت عنوان (الحبس في التهمة) ولعله مؤلف في الحقوق.
وأزعم أن أهم مؤلف وضعه روحي الخالدي كان (تاريخ علم الأدب عند الإفرنج والعرب وفيكتور هيغو) الذي سجل له بحق ريادته في مجال (المقارنية) أو ما اصطلح على تسميته بالأدب المقارن.