لقد خاض شيخ الإسلام معارك ضارية مع معاصريه في منازعات عقائدية وفكرية، فكثر أعداؤه من شتى الطوائف، فكان له خصوم من الصوفية الذين حارب شيخ الإسلام تواكلهم وغلوهم في الزهد، وخروجهم عن منهج الكتاب والسنة، ومن المتكلمين الذين كره تأثرهم بمصادر أجنبية، وإدخالهم في العقيدة الإسلامية من الضلالات التي لا تمت إليها بصلة، ومن الفقهاء الذين جمد تفكيرهم، وركنوا إلى التقليد الجامد، وقفلوا في وجوههم أبواب الكتاب والسنة.