كان الشيخ الشلبي مولعًا بالقراءة وجمع الكتب وقد اقتنى مكتبة حافلةً بالكتب الثمينة والمخطوطات النادرة التي كتبها بيده وعلق عليها وشرحها بأسلوبه. وقد رأيتها ضمن المكتبات المهداة بمكتبة الملك عبد العزيز بالمدينة المنورة وقد أهداها ابنه الفاضل الأستاذ محمد سعيد حفظه الله لتكون مرجعًا لطلاب العلوم ومريديه فجزاه الله خيرًا، وتعد مكتبة الشيخ الشلبي من أكبر المكتبات الموجودة هناك وقد اطلعت على فهارسها فهي تحتوي على 2169 مطبوعة و88 مخطوطة.

وعندما آذنت ساعة الموت توفاه الله في أول ربيع الثاني سنة 1369هـ ودفن في بقيع الغرقد بالمدينة المنورة بعد حياة حافلة بالجهاد والبيان في سبيل الدفاع عن العقيدة الإسلامية ونشرها بين الناس رحمه الله رحمة واسعة وأحسن الله عمله وجعل جنة الخلد مسكنه. ...