-تم عمل الفهارس الآتية:
1 -فهرس الأرباع.
2 -القراءات المتواترة غير حفص.
3 -القراءات الشاذة.
4 -الأحاديث القولية.
5 -الأحاديث الفعلية.
6 -الآثار.
7 -رجال الإسناد.
8 -الأعلام المترجم لهم غير رجال الإسناد.
9 -فهرس شيوخ المصنف.
10 -الفرق والأديان.
11 -الشعر.
12 -الألفاظ المشروحة لغويًا.
13 -موضوعات القرآن الكريم (وهو مستفاد من كتاب: دليل الموضوعات في آيات القرآن الكريم) .
14 -فهرس المصادر والمراجع.
15 -فهرس ترتيب الكتاب ببيان موضع بداية السور والأجزاء والأرباع.