يوصي المؤتمر بما يلي:
تكوين مجلس أعلى باسم"المجلس الأعلى العالمي للمساجد". . تكون أهدافه:
1 -تكوين رأي إسلامي عام في مختلف القضايا والموضوعات الإسلامية في ضوء الكتاب والسنة.
2 -محاربة الغزو الفكري والسلوك المنحرف في حياة المسلمين وبناء الشخصية الإسلامية فكرا وعقيدة وسلوكا.
3 -العمل على تأكيد حرية الدعاة إلى الله وأئمة المساجد والخطباء في الدعوة والتبليغ في إطار الكتاب الكريم والسنة الشريفة والعمل على حمايتهم من أي اضطهاد وتمكينهم من أداء رسالة المسجد.
4 -حماية المساجد من كل اعتداء يقع عليها أو على ممتلكاتها ومن أي انتهاك لحرماتها وإعادة المساجد التي حولت عن طبيعتها إلى أوضاعها الأصلية كمسجد أيا صوفيا وغيره.
5 -الحفاظ على الأوقاف الإسلامية واسترجاع ما عطل أو صور منها وتنميتها.
6 -الدفاع عن حقوق الأقليات الإسلامية في أداء شعائرهم الدينية في المساجد وإيقاف المضايقات التي يتعرضون لها.