1-الإختلافات العقدية وتشمل:
-الخلاف حول طبيعة السيد المسيح Christology ... ... الرومان الكاثوليك يقولون أن للمسيح طبيعتين ومشيئتين ... طبيعة إلهية وطبيعة إنسانية .. ومشيئة إلهية ومشيئة إنسانية ) والأرثوذكس يقولون أن المسيح له طبيعة واحدة ومشيئة واحده فالمسيح هو الله والله هو المسيح ، والموارنه اللبنانيين يقولون ان للمسيح طبيعتين ومشيئة واحده )
-الخلاف حول انبثاق الروح القدس من الأب والإبن. Filioque
الكاثوليك يقولون أن الروح القدس منبثق من الآب والابن والأرثوذكس يقولون أن الروح القدس منبثق من الآب فقط .
2-إختلافات طقسية:
-الخلاف في القداس (أوشية الأباء / قانون الإيمان/مجمع القديسين) .
-الخلاف في التناول ويشمل:
-القربان عندهم من الفطير فقط (ليس فيه خمر)
-عدم الالتزام بالاحتراس 9 ساعات قبل التناول
-إقامة أكثر من قداس على نفس المذبح في يوم واحد
-يمكن للكاهن أن يصلى ويتناول في أكثر من قداس في اليوم الواحد
-عدم مناولة الأطفال وإجراء طقس المناولة الأولى من سن 8 سنوات
-مناولة غير المؤمنين (يمارسها الأساقفة الكاثوليك - خاصة في الغرب - بدون قرار واضح رسمى من الفاتيكان) .
3-إختلافات في الأحوال الشخصية:
-لا يسمحون بالطلاق على الإطلاق مخالفين بذلك ما ورد في: مت5: 32 ، مت 19: 9 ، مر10: 11 ، لو 16: 18
-الزواج بغير المؤمنين (التفسيح البولسى) 1كو7
-بسبب منعهم الطلاق يتوسعون كثيرًا في أسباب بطلان الزواج
4-إختلافات من جهة القديسة العذراء مريم:
-عقيدة الحبل بلا دنس (أى أن العذراء نفسها وُلدت من حنة ويواقيم وهى لا تحمل الخطية الأصلية) Immaculate Conception
-يرون أنها شريكة في عمل الفداء
-يقولون أنه لا تأتى نعمة إلى البشر إلا عن طريق العذراء ويسمونها"سيدة المطهر"
-عصمتها الكاملة من الخطأ
5-إختلافات في موضوع الخلاص والغفران:
-المطهر Purgatory
-يؤمنون أن الإنسان يمكن أن ينال الغفرانات لعدد من السنين أو الأيام عن طريق تلاوة صلوات معنية أو زيارة أماكن مقدسة معينة بأوامر من بابا الكاثوليك .
-يؤمنون بزوائد القديسين أى أن بعض القديسين لهم زوائد من الغفرانات يمكن منحها أو توريثها لغيرهم
-يؤمنون بخلاص غير المؤمنين أى أن الذين حتى لم يؤمنوا ولم يعمدوا كالوثنيين والهندوس وغيرهم من الممكن أن يتناولوا ويتحقق خلاصهم بطريقة لايعلم بها أحد إلا الله وحدة.