وأمّا الهوامش؛ فيوجد عدّة طرق لترقيمها؛ إذ يُمكن وضعُ الأرقام كما يلي:
1 -وضع الأرقام بشكل مسلسل لكلّ صفحة على حِدة.
2 -وضع الأرقام بشكل مسلسل من أوّل الكتاب إلى نهاية الفصل.
3 -وضع الأرقام بشكل مسلسل مِن أوّل الكتاب إلى آخره.
وأحيانًا يضع الكاتب هامشين؛ فيضع الكاتب في متن الكتاب أعلاه نوعَيْن من الترقيم أحدهما بالأرقام العربية، والثاني بالأرقام الإفرنجية، كلٌّ منهما في هامش.
يجب ذكر المصدر أوالمرجع على نَسَقٍ واحد؛ فلا نقول: (تاريخ الطبري) مرّةً، ونذكره باسم: «تاريخ الرسل والملوك للطبري» مرّةً أُخرى؛ وإنْ كان المسمّى واحدًا؛ بل يجب اعتماد طريقة واحدة، واستطرادها في البحث جميعِه.
يوجد عدّة طرقٍ لترقيم صفحات البحث؛ وهي:
1 -الترقيم بالأرقام المسلسلة لكلّ صفحة؛ وترقّم الكتب المطبوعة به عادة؛ مثل: 1، 2، 3، 4 ... .الخ.
2 -الترقيم بالأرقام المسلسلة لكلّ ورقة؛ وترقّم به الأطروحات الجامعية والرسائل.
3 -الترقيم بالأرقام الرومانية؛ وهي كثيرة الاستعمال في مطبوعات المستشرقين، والكتب العربية التي طُبعت في أوربة في القرون الماضية، والأعداد هي:
4 -الترقيم بالحروف؛ حيث ترقّم الصفحات حسب الحروف الأبجديّة، وهي (أبجد هوز حطي كلمن سعفص قرشت ثخذ ضظغ) فإن انتهى الترقيم بها نأخذ الحرف الأول مشفوعًا بالحروف (أأ - أب - أج - أد .... ) .
5 -الترقيم المتعدّد للصّفحات؛ حيث نجد الكتاب الواحد متعدّد الترقيم، كأن تُرتّب صفحات المقدّمة أبجديًا أوبالأرقام الغربية أوالرومانية، ثم يُرتّب متن الكتاب بالأرقام العربية.
يُتّبع في ترتيب البحث الترتيبُ التالي: