10 -ضعف قدرة المعلم على استخدام أو توظيف الأجهزة بما يحقق أهداف الدرس.
11 -ضيق الوقت مما يؤدي إلى عدم إنهاء العمل المخبري وعدم الحصول على نتائج.
12 -كثرة أعداد التلاميذ وما ينتج عنه من مخاطر.
13 -عدم المحافظة على النظام والنظافة.
14 -عدم قدرة المعلم على إسداء التوجيهات المناسبة عندما يتطلب الأمر ذلك.
ويرى الباحث أن من أهم المعوقات التي تحول دون استخدام المختبر في تدريس مادة العلوم:
1-زيادة النصاب التدريسي لدى معلم المادة.
2-طول المنهج الدراسي بالنسبة للخطة الدراسية.
3-القيود الإدارية والروتينية التي يمكن أن تمنع أو تحد من استخدام المختبر.
4-عدم قناعة بعض المعلمين بأهمية استخدام المختبر.
5-قلة المواد والأجهزة اللازمة لإجراء التجارب، أو صعوبة الوصول إليها.
6-كثرة أعداد الطلاب بالصف الواحد وضيق المساحة وقلة المقاعد في غرفة المختبر.