فيما تقدم تم سرد الأسباب المعروفة والظاهرة للأمية، لكن هناك أسباب غير ظاهرة تختفي تحت مسميات متعددة ومن هذه الأسباب:

1 -انتشار ظاهرة التنمر والعنف بين الطلبة وخاصة في المرحلة الابتدائية وتعرف ظاهرة التنمر"إلحاق بعض الأطفال أذى معنويا أو جسديًا بأطفال آخرين أو سيطرة فرد أو مجموعة على أفراد أو مجموعة أخرى بهدف السيطرة والتسلط عليهم"حيث أن هذه الظاهرة تتسبب في عدم رغبة الطفل المتنمر عليه أو المعتدى عليه من الذهاب إلى المدرسة وتراجع أدائه الدراسي والتقصير في الواجبات المدرسية. (موقع الأخصائية رانيا زاهدة) .

2 -التخلف القرائي يعد التخلف القرائي واحد من المشاكل التي يعاني منها الطلبة والتي أخذت اهتمام المختصين لما لها من أثر على التعلم ويمكن تعريفها"القصور في تحقيق الأهداف المقصودة من القراءة"وللتخلف القرائي صور متعددة منها القصور في فهم معنى المقروء، أو إدراك ما يشتمل عليه من علاقات بالمعاني الأخرى، كذلك من صورهِ البطء في القراءة والنطق المعيب. (شاكر، 1993 م، ص 83) .

3 -إهمال الطلبة ذوو صعوبات التعلم أو ما يسمى في بعض المصادر بذوي الاحتياجات الخاصة، والذين يعرفون"من لديه اضطراب في جانب أو أكثر في الوظائف العقلية أو النفسية التي تشمل التذكر والانتباه والتخيل وحل المشكلات ويظهر بعدم قدرته على الانتباه والتفكير والنطق والقراءة والكتابة والقيام بالعمليات الحسابية. الخ" (العزة، 2002 م، ص 41) . مما يؤدي إهمالهم أو عدم اكتشافهم إلى خروجهم من المدرسة في أول مراحلها وبالتالي يصبحون أميين.

4 -ضعف الخدمات المدرسية ولكل المراحل والمتمثلة في التهوية ودورة المياه وأماكن شرب المياه مما تؤدي إلى أتعاب نفسية الطالب وتتسبب في عزوفه عن التعليم.