لكن التقييم يكتنفه معوقات ومنها:

1 -السرية عند كتابة التقرير، فكيف سيطور الموظف مهاراته إذا لم يعلم بأخطائه وجوانب التقصير لديه، وقد طويت أوراقه في أدراج المكاتب والملفات السرية، علما بأن النظام ينص على عدم السرية: نصت المادة 26/ 6 من لائحة تقويم الأداء الوظيفي على أنه للموظف المعد عنه التقرير, حق الاطلاع على التقرير الذي أعد عنه من أجل إعطائه الفرصة لمعرفة وجهة نظر الإدارة حوله ولتحسين وضعه، والعلنية في الاطلاع تقتصر على الموظف المعني ورئيسه المباشر ومعتمد التقرير، وما عداهم يعتبر التقرير سريًا عليهم، ومن ناحية الاعتراض على ما ورد بالتقرير والتظلم منه يكون في حالة حصوله على تقدير غير مرضي خلال 15 يومًا من إخطاره بذلك وفقًا للمادة 36/ 7 من اللائحة نفسها.

2 -كتابة التقرير مرة واحدة في آخر العام، وهذا عليه ملحوظات منها:

الأولى: طول المدة تؤدي إلى نسيان سلبيات وإيجابيات الموظف 0

الثانية: أن المدير يقيم الموظف في آخر أيام العام 0

الثالثة: أن الموظف يهمل طيلة العام وقبيل كتابة التقرير بأيام يحسن من أدائه أمام المدير 0

3 -المزاجية عند كتابة التقرير، أو بالمعنى العامي (الشللية) إي المقربين من المدير لهم الدرجات العليا وغيرهم لا 0

4 -التقييم من خلال نقاط معينة محددة وإهمال باقي نقاط التقييم، كمن يقف عند ظاهر الحضور و الانصراف فقط، ويكون تقييم الموظف في نهاية العام من خلال دفتر الحضور والانصراف فقط متجاهلًا فاعلية الموظف و إنتاجه وإتقانه لعمله 0

5 -قصور بعض نماذج تقويم الأداء الوظيفي ونقصها، فسجلات التقويم تحتاج إلى إعادة نظر وطول دراسة 0

6 -بعض الدوائر لا تمنح جميع الموظفين المميزين تقدير امتياز وإنما تمنح عدد قليل منهم بحجة أنه لابد أن تتفاوت التقارير وأن لا تتعدى النسبة حد معين 0

1 -استخدم نظام التقييم الفوري والمباشر فهذا التقرير مفيد بإذن الله 0

2 -اجعل لكل موظف سجل خاص تدون فيه السلبيات والإيجابيات على مدى عام كامل، ثم يطلع الموظف عليها بين الحين والآخر مع المناقشة والحوار لأجل التطوير 0