1 -آيات بينات (الآيات البينات) كتبه في تأييد المذهب السني وردًّا على المذهب الشيعي الاثنا عشري، فأثبت فيه بطلان المذهب الاثنا عشري بأدلة قاطعة من الكتاب والسنة والعقل (1) .
2 -مضامين تهذيب الأخلاق وهو عبارة عن موضوعات كتبها لمجلة"تهذيب الأخلاق"، قد جمعها ورتبها الشيخ ملك فضل الدين (2) .
3 -وكتاب"تقليد وعمل بالحديث": ألفه تأييدًا في التمسك بالمنهج السني في العمل بالحديث الصحيح الثابت بعد التثبت والتحقيق.
4 -كتاب"المحبة والشوق"كتبها في بداية أمره.
5 -كتاب"مسلمانون كي تهذيب" (ثقافة المسلمين) (3) .
ومن أهم الموضوعات التي تكلم فيها مهدي علي:
1 -التعريف بالإسلام.
2 -التفسير بالرأي.
3 -والعمل بالحديث.
4 -تطبيق المعقول بالمنقول.
5 -تحريف ألفاظ المصطلحات العلمية.
6 -حقيقة الإجماع.
7 -المؤاكلة مع أهل الكتاب وطعامهم.
8 -الدين والعلم الجديد- الطبيعة والفطرة والإسلام.
ومن خلال هذه الكتب والموضوعات يمكن تحديد منهجه.
(1) ينظر سرسيد أور أن كي نامور رفقاء (السيرسيد ورفقاءه المعروفون) لسيد عبد الله ص: 75.
(2) طبعه ونشره اندين استيم بريس لاهور.
(3) ينظر سر سيد أور أن كي نامور رفقاء: سيد عبد الله ص: 75.