من حيث التشدد في التصحيح وتوزيع الدرجات على الأسئلة أو من حيث ارتفاع نسبة النجاح المحددة ب (65%)
(3) المقرر في عمومه يواجه مشكلة الضعف في مستوى الطلاب وقدراتهم الدراسية واللغوية ويعود ذلك إلى أن بعضهم دخل الجامعة بنسبة نجاح أقل.
(4) يواجه المقرر إهمالًا من الطلاب وعدم مبالاة وتهرب من دراسة القرآن الكريم إضافة إلى ضعف الرغبة في التعلم.
(5) ضعف مستوى الطلاب العام ومنه ضعفهم في مهارات اللغة العربية وتأثر ألسنة بعضهم بلهجاتهم المحلية، وعندما وضع المقرر لأول مرة لم يكن الطلاب وقتها بنفس مستوى الطلاب الحاليين.
(6) قلة رغبة بعض الطلاب في تعلم القرآن الكريم وبعضهم لا يؤمن بفكرة تقرير حفظ القرآن في المرحلة الجامعية؛ لتأثرهم بزملائهم في بقية الجامعات السودانية الأخرى إذ لا يوجد فيها مثل هذا المقرر.
(7) انشغال الطلاب بالسعي والعمل لتحسين ظروفهم المعيشية لأنهم يواجهون مشكلات كثيرة في هذا الجانب، مما يؤثر سلبًا على أدائهم التعليمي ولا يقتصر ذلك على القرآن الكريم وحده.
(8) لا يسعى الطلاب إلى تعلم القرآن الكريم خارج الجامعة لدى الخلاوى والمساجد ودور تحفيظ القرآن الكريم، فمن طبيعة القرآن الكريم أن يحتاج إلى أن يعزز تعلمه من عدة