-... ضيق الوقت المتاح لمبحث التربية الإسلامية بعامة ، والوقت المخصص لموضوعات السنة النبوية بخاصة ، حيث يمكن أن يعطى ثقل نسبي أكبر من خلال جعل النصوص المرتبطة بالسنة النبوية هي المحور لتدريس موضوعات التربية الإسلامية الأخرى من فقه وعقيدة وغيرها .
-... صعوبة المفاهيم والمصطلحات وبخاصة في علوم الحديث الشريف التي تتطلب خبرات سابقة ، مثل: مفاهيم علم المصطلح التي تحتاج إلى شبكة مفاهيمية مترابطة كي يتمكن الطلبة من استيعاب تلك المصطلحات ، ولا يمكن للمعلم السير في عملية التعليم بيسر وسهولة إلا إذا شرح المفاهيم والمصطلحات ذات العلاقة ، مثل: مفهوم الشذوذ ، والعلة ، والتدليس وغيرها .
-... إسناد تدريس مادة التربية الإسلامية لغير المتخصصين في الشريعة الإسلامية ، بحيث يكمّلون نصاب التدريس المطلوب منهم إداريًا ، وهذا يكون على حساب نوعية التدريس الذي يقدم إلى الطلبة ، لأن هؤلاء المعلمين والمعلمات لا يمتلكون الكفايات اللازمة لتدريس مادة التربية الإسلامية ، فلديهم ضعف تربوي خاص بالتربية الإسلامية ، وضعف أكاديمي أيضًا .