يتم الختان الشرعي عبر خطوات هي:

أولًا: تُهيأ الطفلة من الناحية النفسية بالشرح البسيط، وقراءة بعض الأدعية والقرآن الكريم، وتُثقف الأم صحيًا بتوضيح الحكم الشرعي لختان الأنثى، وبالشرح المبسط لتشريح المنطقة وللعملية وفوائدها، وكيفية متابعة الجرح حتى يشفى. والتأكد من عدم وجود حالات نزف دموى وراثي بالأسرة، وعدم وجود تشوهات خلقية بالأعضاء التناسلية للطفلة.

ثانيًا: تُعقم المعدات بواسطة فرن تعقيم أو غلاية، ويُعقم سطح وداخل القلفة بالمحاليل المعقمة المعروفة مثل (الإيثانول) .

ثالثًا: ُتحرك القلفة (Prepuce) إلى الخلف حتى تنفصل أى إلتصاقات لها مع رأس البظر. وحتى تظهر نهايتها العليا الملتصقة مع جلد جسم البظر.

وذلك يساعد على قطع الطبقة السطحية والداخلية للقلفة دون أن يقطع معها شئ من رأس البظر أو من جلد البظر، وحتى لا تنمو القلفة مرة أخرى.

وفى حالة صعوبة فصل القلفة عن رأس البظر يجب تأجيل ختان الطفلة إلى وقت يسهل فيه ذلك.

رابعًا: تُخدر القلفة بحوالى واحد (مل) من البنج الموضعي (1% lidocaine) بواسطة حقنة صغيرة (Hypodermie needle) .

ويكون ذلك بتثبيت الجلد الذى يغطى جسم البظر بإبهام اليد اليسرى، ثم يحقن البنج بين طبقتي القلفة من أعلى إلى أسفل، مبتدئين بخط التقاء القلفة بجلد جسم البظر.

ويُنتظر لحوالى ثلاثة دقائق للتأكد من تخدير المنطقة وليزول الانتفاخ الذى أحدثه البنج.

خامسًا: تُسحب القلفة المخدرة إلى أعلى من مقدمتها، بواسطة جفت تشريح، لإبعادها عن رأس البظر (يُراعى سحب طبقتي القلفة السطحية والداخلية) وتُقبض بواسطة جفت شريان (يُراعى عدم قبض جزء من جلد جسم البظر) .

يُزال الجزء الذى فوق الجفت بواسطة مقص معكوف.

يُترك الجفت الضاغط في مكانه لفترة 5 - 10 دقائق، حتى لا يحدث نزيف، ثم ُيزال الجفت.

فى حالة حدوث نزيف يُضغط الجرح مرة أخرى بالجفت أو توضع غرزة من الكاتقط (2/ 0 catgut) مكان النزيف بشرط عدم ملاقاة طرفى الجلد المقطوع مرة أخرى.

يُغطى الجرح بقطعة معقمة من شاش الفازلين مع القطن وتُثبت، فقط بواسطة الملابس الداخلية للطفلة.

يمكن إزالة الشاش بعد أربع ساعات.

فى حالة حدوث نزيف بالمنزل يضغط الجرح بالقطن مرة أخرى وتستشار الطبيبة إذا لزم الأمر.

لا يحتاج الجرح إلى غيار أو مضادات حيوية من ناحية روتينية.