مؤلفات الإمام البخاري رحمه الله: الجامع الصحيح/الأدب المفرد/ جزء رفع اليدين/ جزء قراءة الفاتحة خلف الإمام/ بر الوالدين/ التاريخ الكبير/ التاريخ الأوسط/ التاريخ الصغير/ خلق أفعال العباد/ الضعفاء/ المسند الكبير/ التفسير الكبير/ الأشربة/ الهبة/ أسامي الصحابة/ الوحدان/ المبسوط/ العلل/ الكُنى/ الفوائد/ قضايا الصحابة.
وهذه الكتب منهاماهو موجود، ومطبوع، أو مخطوط. ومنها ما عُرف بذكر بعض الأئمة له ونقلهم.
وفاة الإمام البخاري رحمه الله: لما خرج الإمام البخاري رحمه الله من بخارى كتب إليه أهل سمر قند يخطبوه إلى بلدهم فسار إليهم فلما كان بقرية ( خَرْ تَنْك) بفتح الخاء بفتح المعجمة وإسكان الراء وفتح الفوقانية وسكون النون. وهي على فرسخين من سمر قند.
قال جمال الدين القاسمي: حدثني أحد صلحاء بخارى وكان رفيقي في رحلتي إلى المدينة المنورة أن البلدة التي دفن بها الإمام البخاري المسماة بخر تنك، تسمي الآن ( خاجا باد) .
بلغ الإمام البخاري أنه وقع بينهم بسببه فتنة فقوم يريدون دخوله، وقوم يكرهون.
فأقام بها حتى ينجلي الأمر فضجر ليلة ودعا وقد فرغ من صلاة الليل، اللهم قد ضاقت على الأرض بما رحبت فاقبضي إليك فمات في ذلك الشهر.
قال القسطلاني: فلما كان بخر تنك وهي على فرسخين من سمر قند وقعت الفتنة بينهم بسببهِ وكان له أقرباء بها فنزل عندهم حتى ينجلي الأمر فأقام أيامًا فمرض حتى وجَّه إليه أهل سمرقند رسولًا يلتمسون خروجه إليهم فأجاب وتهيأَ للركوب ولبس خفيه وتعمم فلما مشيَ قرابة عشرين خطوة أو نحوها إلى الدابة ليركبها قال أرسلوني فقد ضعفت فأرسلوه فدعا بدعوات ثم أضطجع فقضيَ فسال العرق حتى أُدرج في أكفانه.
توفي رحمه الله تعالى: ليلة السبت عند صلاة العشاء ليلة الفطر، ودفن بعد صلاة الظهر، وكانت مدة حياته اثنان وستين سنةً إلا ثلاثة عشر يوما.