٦ - "الزهد" ، قال ابن حجر: (ولأبي عيسى كتاب "الزهد" مفرد لم يقع لنا) (١) .
٧ - "الشمائل" (٢) ، وهو مشهور جدا، ولعله أول من أفرد ذلك بالتصنيف.
قال ابن كثير عن كتابه هذا: (قد صنف الناس في هذا قديما وحديثا كتبا كثيرة مفردة وغير مفردة، ومن أحسن مَنْ جمع في ذلك فأجاد وأفاد الإمام أبو عيسى محمد بن عيسى بن سورة الترمذي ﵀ ، أفرد في هذا المعنى كتابه المشهور بـ "الشمائل" ) (٣) .
٨ - "العلل الصغير" ، وهو مطبوع، وهو الذي في آخر "الجامع" (٤) .
٩ - "العلل الكبير" (٥) ، والموجود منه بترتيب أبي طالب القاضي، وأغلبه موجود في "الجامع" ، وليس كله (٦) .
١٠ - الكتاب الذي فيه الموقوف، ذكره الترمذي في العلل آخر "الجامع" ، فقال: ( … وقد بينا هذا على وجهه في الكتاب الذي فيه الموقوف) (٧) .