افتتح المعهد في عام 1402هـ وذلك بحضور جمع من المشايخ والعلماء وعلى رأسهم سماحة الشيخ / عبد الله بن محمد بن حميد رحمه الله رئيس مجلس القضاء الأعلى، وشرف الحفل صاحب السمو الملكي الأمير سلمان بن عبد العزيز، وصاحب السمو الأمير / محمد بن سعود الكبير . وذلك تحت إشراف فضيلة رئيس الجمعية الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم الشيخ / عبد الرحمن بن عبد الله آل فريان .

وقد تم وضع المناهج التعليمية من قبل مجلس الجمعية الخيرية وتحت إشراف جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية، وأصدر مجلس إدارة الجماعات الخيرية برئاسة مدير جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية في جلسته عام 1402 / 1403هـ المنعقدة في 7 / 5 / 1403هـ قرار رقم 17 بالموافقة على إنشاء معهد القرآن الكريم وعلومه واعتمدت عمادة شئون الطلاب بجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية بالرياض، في جلستها الثالثة المنعقدة بتاريخ 12 / 4 / 1404هـ والمعتمد محضرها من سعادة وكيل الجامعة بتاريخ 2 / 8 / 1404هـ القرار رقم (4) 1403 / 1404هـ

"تعتبر ثانوية معهد القرآن الكريم بالرياض مؤهلًا بكليات الشريعة وأصول الدين واللغة العربية بالجامعة".