الموافقة على إنشاء الجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، وفروعها، وإقرار النظام الداخلي لكل منها، والموافقة على تعديله.
تعيين رئيس الجمعية، ونائبه، والمسؤول المالي، من بين أعضاء مجلس الإدارة في الجمعية، الذين تم اختيارهم من قبل الجمعية العمومية، ويكون ذلك بناء على ترشيح رئيس المجلس الأعلى للجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم.
اقتراح إعانة الحكومة السنوية للجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، ومدارس تحفيظ القرآن الكريم الخيرية.
اقتراح مشروع الميزانية الخاصة بالأمانة العامة للمجلس الأعلى للجمعيات الخيرية.
توزيع ما يعتمد في الميزانية من إعانة للجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، ومدارس تحفيظ القرآن الكريم الخيرية، وفقًا لحجمها وإيراداتها وظروفها البيئية.
الاطلاع على التقرير السنوي الذي يعده الأمين العام عن نشاط الأمانة، ونشاط الجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم، ومدارس تحفيظ القرآن الكريم، واتخاذ ما يراه بشأنه.
النظر في الموضوعات المتعلقة بالجمعيات الخيرية لتحفيظ القرآن الكريم التي تحال إليه من الجهات الحكومية، أو الهيئات والمؤسسات الخاصة، أو التي تعرض عليه من قبل رئيسه وأعضائه.