شهد هذا العصر وقوع كثير من النزاعات و الحروب بين الإمارات الإسلامية ، وفي بعضها يكون طرفا النزاع أخوين أو من أسرة واحدة ، ومن أبرز هذه الأحداث:

في سنة ( 509) السلطان السلجوقي محمد بن ملك شاه صاحب العراق يغزو الأمير طغتكين صاحب دمشق والأمير برشق صاحب ماردين لعصيانهما سلطته وقطع الخطبة له ، فيلجأ الأميران إلى الفرنج ، فيقتل الفرنج من المسلمين خلقًا كثيرًا .

وفي سنة ( 513 ) تقع حروب شديدة بين السلطان محمود السلجوقي وعمه سنجر بن ملك شاه .

وفي سنة ( 514 ) وقعه عظيمة بين السلطانين محمود ومسعود ابني محمد بن ملك شاه .

وفي سنة ( 525 ) يعود العداء بين الأخوين محمود ومسعود ، فيتواجهان للقتال ثم يقع الصلح .

في سنة ( 526 ) تقع الحروب بين الخوارزميين والسلاجقة .

في سنة ( 533 ) كانت وقعة عظيمة بين الخوارزميين والسلاجقة .

في سنة ( 547 ) يقع القتال بين السلاجقة بقيادة سنجر ، وبين الغوريين بقيادة الحسين بن الحسن .

في سنة ( 569 ) يموت نور الدين محمود زنكي فيتفرق أمر زنكي وينشب الخلاف بينهم .

في سنة ( 589 ) يموت صلاح الدين الأيوبي فتضطرب الأمور بين أبنائه وبين أخيه العادل ويتفرق شملهم في مصر والشام .

في سنة ( 590 ) تقع الحرب بين السلاجقة بقيادة طغرل الثاني والخوارزمية بقيادة خوارزمشاه تَكَش ، وانتهت بقتل طغرل وانتهاء أمر السلاجقة واستيلاء الخوارزمية على بلادهم .

في سنة ( 600 ) تقع حروب كثيرة بين الخوارزمية والغورية .

ثالثًا ) السنة والشيعة: