وفاته: في سنة 1391 هـ / 1972 م خرج الشيخ ابن الحبيب من بيته بمكناس قاصدا حج بيت الله الحرام للمرة الثالثة رفقة بعض مريديه وتلامذته. وفي طريقه وهو ينزل بالمدن التي يصادفها بالمغرب ثم بالجزائر .. وصل إلى مدينة البليدة بالقطر الجزائري وبها مرض .. فوافاه أجله، وانتقل إلى جوار ربه يوم الاثنين 23 ذي القعدة 1391 هـ الموافق ل 10 يناير 1972 م، ودفن بزاية هناك كان قد دشنها قبل وفاته بأسبوع.

وطبقا لوصيته، وبطلب من أهله وعشيرته ومريديه نقل جثمانه من مدينة البليدة إلى مدينة مكناس بالمغرب الأقصى ليدفن بزاويته الكبرى، وقد تم ذلك يوم الاثنين 14 ذي الحجة 1391 هـ الموافق ل 31 يناير 1972م بعد عشرين يوما من وفاته، فكانت حياته وقفا على الدعوة إلى الله تعالى. وقد ترك الكثير من المؤلفات نذكر منها:

1 -ديوان بغية المريدين السائرين، وتحفة السالكين العارفين (لقي انتشارا كبيرا وقد ترجم إلى عدة لغات)

2 -كتاب الطبقات (في ذكر من اجتمع معهم من العارفين)

3 -شرح الصلاة المشيشية

4 -شرح الوظيفة المشهورة ب (الحفيظية)