خلف محمد المصطفى الشيخ مربيه ربه عدة تأليف في شتى العلوم الظاهرة و الباطنة و في التصوف و الطب و الرحلات و الأسرار و التوحيد و البلاغة و النحو و بالتالي كون مكتبة متنوعة في مختلف العلوم الإسلامية وساهمت مؤلفاته في بلورة كثير من ميادين العلم و المعرفة و انتفع بها العلماء و طلاب العلم و مريديه داخل البلاد وخارجه وقد كان الشيخ غزير الانتاج رغم الظروف الصعبة و كان يصطحب في رحله و ترحاله مكتبة متنقلة على غرار والده تضم أمهات الكتب و الاوراق و الحبر الشيء الذي مكنه من تاليف عشرات الكتب و لا يكاد يخلو بيت من بيوت اسرته او اقربائه او مرافقيه او مريديه او بيوت معاصريه بل و حتى المتاحف و الخزانات الدولية و الوطنية (مكتبة الوقش بتطوان التي أرسل لها عدة كتب) إلا و تجد رسالة له أو كتابا أو تأليفا من تاليفيه او اشياء تخصه. من بين هذه الدول: فرنسا (بمتحف مونبولي العسكري يوجد مدفعه و حزامه) اسبانيا، موريتانيا، السعودية، الإمارات وغيرها من الدول.
تآليفه: