تقع في الجانب الجنوبي الغربي لسطح الصخرة المشرفة، عند الدرج الكائن تجاه باب السلسلة، أنشأها الملك شرف الدين عيسى سنة 604 هـ، لتدريس اللغة العربية وقواعدها، وكانت هذه المدرسة موقوفة على فقهاء المذهب الحنفي.
أصبحت هذه المدرسة مكتبة للمجلس الإسلامي الأعلى، ثم تحولت إلى مقر للمكتب المعماري الهندسي لاعمار قبة الصخرة المشرفة سنة 1956 م، وهي اليوم مكاتب تابعة لدائرة الأوقاف الإسلامية في القدس.
المدرسة الغادرية ...
تقع هذه المدرسة في الرواق الشمالي للمسجد الأقصى، بين باب حطة وباب الأسباط، أوقفها الأمير ناصر الدين محمد بن الغادر سنة 836 هـ.
المدرسة الدويدارية ...
تقع بباب الدويدارية المعروف اليوم بباب الملك فيصل، على يسار الداخل إلى المسجد الأقصى، أنشأها الأمير علم الدين الدويدار سنة 695 هـ، عرفت حديثًا بالمدرسة البكرية.
المدرسة الباسطية ...
تقع في الرواق الشمالي للمسجد الأقصى، لصق المدرسة الدويدارية من جهة الشرق، أمر بانشائها شيخ الإسلام شمس الدين محمد الهروي ولكنها لم تكتمل بموته فأتم بناءها القاضي زين الدين عبد الباسط بن خليل سنة 834 هـ.
المدرسة الكريمية ...
تقع في الرواق الشمالي للمسجد الأقصى، لصق باب حطة من جهة الشرق أوقفها الشيخ كريم الدين بن المعلم سنة 718 هـ.
المدرسة الأمينية ...
تقع هذه المدرسة في الرواق الشمالي للمسجد الأقصى غربي باب الملك فيصل، أوقفها الصاحب أمين الدين عبد الله سنة 730 هـ، إلا أنها تحولت إلى سكن لعائلة الإمام المقدسية.
المدرسة الفارسية ...
تقع هذه المدرسة في الرواق الشمالي للمسجد الأقصى إلى الغرب من باب الملك فيصل، أوقفها الأمير فارس الدين البكي، وهي اليوم دار سكن لعائلة الدجاني.
المدرسة الملكية ...