ونتيجة لهذه الصفات القارية يتميز مناخ المدينة المنورة بالجفاف، إذ يبلغ متوسط التساقط السنوي نحو 42ملم يصل معظمه في أشهر نوفمبر ويناير، أو مارس وإبريل، ونادرا ما تسقط الأمطار في فصل الصيف، وهي غالبا من الأمطار الإعصارية التي تجلب السيول التي تمتليء بها أودية المدينة المنورة. وقد ترتفع معدلات المطر في بعض السنوات، كما حدث في سنة 1971م حين بلغ المعدل السنوي نحو 104ملم، وتنخفض في بعض السنوات إلى أقل من 1مم، كما حدث في سنة 1973م. ولعل هذا هو السبب الرئيسي في انخفاض معدل الرطوبة النسبية في المدينة المنورة إلى أقل من 5% في أشهر يونيو ويوليو، وارتفاعها النسبي في أشهر نوفمبر ويناير وفبراير إلى نحو 55%. والرياح السائدة في المدينة المنورة هي الرياح الغربية، والجنوبية الغربية، والشمالية الغربية، والجنوبية الشرقية، وهي رياح متوسطة السرعة تتراوح بين 20-25 عقدة/الساعة، وقد تتسرب في بعض أيام السنة الرياح الشرقية، أو الشمالية الشرقية، وهي رياح حارة تحدث غالبا في فصل الصيف. أما الرياح الشديدة التي تتجاوز سرعتها 40 عقدة/الساعة فهي نادرة وغالبا ما تأتي من الاتجاهات الغربية والجنوبية الغربية. ولعل سبب ذلك هو انخفاض الضغط الجوي بشكل عام في المدينة المنورة، فإنه يتراوح بين 932-935 مليبارا في أشهر الصيف، ويرتفع قليلا في أشهر الشتاء إلى نحو 950مليبارا.