وذهب بعض العلماء إلى أنّ ترتيب المصحف كان باجتهاد الصحابة، واستدلوا على ذلك بما ورد من أنّ مصاحف بعض الصحابة، كعلي بن أبي طالب، وأُبي بن كعب، وابن مسعود، كان ترتيبها مختلفًا. ومثل هذا لا يصلح دليلًا، لأنّ نزول الآيات والسور لم يكن مرتبًا مما يجعل السور التي يكتبها الناس لأنفسهم غير مرتّبة، وهذا أمر متوقع في مثل هذه الحالات. ولكنّهم عندما أرادوا أن يجمعوا القرآن بصورة رسمية وجدناهم يُجمِعون على ترتيب السور، من غير خلاف بينهم.
ذهب السيوطي والبيهقي إلى القول بأنّ ترتيب سور المصحف توقيفي، إلا سورة الأنفال وسورة والتوبة.
... وبعد تجلّي عطاء الإعجاز العددي في القرآن الكريم، فإنّ مثل هذا الاختلاف يُصبح تاريخيًا، لأنّ مسائل الإعجاز العددي تَحسم ذلك. وسيتّضح لنا عند الحديث عن إعجاز القرآن الكريم، أنّ قول الجمهور في ترتيب المصحف هو الحق.
أسماء السور:
... ... أسماء السور توقيفيّة، وهناك بعض السور لها أكثر من اسم توقيفي ثبت عن رسول الله، صلى الله عليه وسلم، مثل: سورة محمد وتسمّى القتال، وسورة غافر وتسمّى المؤمن، وسورة الإسراء التي تسمّى سورة بني إسرائيل. أما الأسماء التي هي من اجتهاد العلماء فلا يجوز إثباتها في المصحف، وكل ما أثبته العلماء في المصاحف من أسماءٍ للسور هو توقيفي. وجدير بالذكر أنّ أبحاث مركز نون قد أثبتت أنّ أسماء السور تحمل أسرارًا يتعلق بعضها بالإعجاز العددي للقرآن الكريم.
عدد الآيات:
... ... أشهر الأقوال في عدد آيات القرآن الكريم هي الآتية: