الاول: ضرب الافواج السياحية و البنوك (ضرب الاقتصاد المصري)

الثاني: ـ اغتيال كبار المسئولين و رجال الشرطة (اعمدة النظام العسكري) في المحور الاول قامت الجماعة باحدى عشر عملية اسفرت عن مقتل 102 من السياح و استطاعت الجماعة في آخر عملية في نوفمبر 97 من شل حركة السياحة المصرية و ضربها تمامًا

اما النبوك فقد قام اعضاء الجناح العسكري في الجماعة بضرب خمسة بنوك و تفجيرها.

اما المحور الثاني: ـ فقد استطاعت الجماعة من الاعداد لثلاث محاولات لاغتيال الرئيس حسن مبارك خلال الفترة من 92 في عام 1995 حسب ماورد في وسائل الاعلام المصرية.

الاولى: كانت علي يد مجموعة من العائدين من افغانستان.

الثانية: كانت علي يد مجموعة من ضباط الجيش الذين انضموا للجماعة بطريقة سرية.

الثالثة: كانت في اثيوبيا و علي ايدي قادة الجناح العسكري في الخارج

اما بالنسبة للوزراء فقد قامت الجماعة بثلاث عمليات ضد وزير الداخلية ووزير الاعلام و رئيس مجلس الشعب المصري.

و على مستوي افراد قوات الامن فقد اغتالت الجماعة 27 قائدًا من قادة اجهزة الامن ما بين لواء و عقيد و ضابط كان من بينهم اللواء رؤوف خيرت رئيس جهاز مباحث امن الدولة بوزارة الداخلية.

كما استهدفت الجماعة الاسلامية الاقباط الذين كانوا يعلمون كمخبرين سريين لجهاز امن الدولة احيانًا فقامت بخمسة عمليات قتلت فيها 34 فردًا.

اما عن استهداف دوريات الامن في المحافظات ففي كل اسبوع تقريبًا كانت الجماعة تقوم بعملية.

ومن الاحصاءات في فترة المواجهة مع النظام من 92 الى 97: