لهذه المخطوطات ، وقد صدر حتى الآن خمسةُ أجزاء من الفهرس العام للمكتبة ، ويتوالى صدور باقى الأجزاء تِباعًا .
أما نوادرُ المخطوطات ببلديَّة الإسكندريَّة ، فهى لاتكاد تقع تحت الحصر ؛ وهى نوادر خطيَّةٌ من كل قرنٍ ، وفى كل فنٍّ .. فمن ذلك:
الجَامِعُ الصْحيحُ للإمام مسلم بن الحجاج النيسابورىِّ ، كتبها خلف بن حكيمٍ، بقلمٍ كوفىٍّ ، سنة 368 هجريَّة، وتقع في 233 ورقةً .
المُدَوْنة والمُخْتَلطَةُ في فقه المالكيَّة . مخطوطةٌ نفيسة في أربعة مجلداتٍ مكتوبة على رَقِّ الغزال ، كلُّ مجلدٍ محفوظٌ في علبة من الجلد الأخضر الفاخر ، كُتبت جميعًا بقلمٍ مغربىٍّ ، في تواريخ مختلفةٍ ، بداية من سنة 499 إلى سنة 530 هجريَّة.
الجامِعُ لأَخلاق الرَّاوى وآداب السَّامع للخطيب البغدادىِّ ، المتوفَّى سنة 463 هجريَّة، وبآخر المخطوطة سماعٌ يفيد أنَّ النسخة سُمعت وأُجيزت من أبى القاسم المبرد بن محمد بن الحسن المعروف بابن البزورى، الذى سبق له أن سمع الكتاب على مؤلِّفه الخطيب البغدادى والسماع مؤرَّخٌ بسنة 529 هجريَّة ، مما يعنى أنَّ المخطوطة قريبةُ العهد من عصر المؤلِّف .
رِسَالَةُ الحُدُودِ لأبى الحسن سعيد بن هبة الله الطبيب، المتوفَّى 495 هجريَّة، نسخة قديمة مهترئة ، كُتبت في عصر المؤلِّف ، تقع في 40 ورقةً .
غَايةُ المَقْصِدِ في زَوَاِئدِ المُسْنَدِ لنور الدين الهيثمى ، المتوفَّى 807 هجريَّة، كتبها عاصم بن محمد بن إسحق بقلمٍ نسخىٍّ ، سنة 793 هجريَّة .