بمكتبة آية الله العظمى المرعشي ـ قدس سره ـ بقم. وقد جاء توصيف النسخة في المجلد الثالث من فهرس النسخ المصورة في المكتبة.

وهذه النسخة أصل لبعض النسخ الآتي ذكرها كما سأشير لذلك. وتختلف مع القسم الأول في السياق، كما انها تنقص عنه شيئا؛ إذ أنها تشرع بالمباحثة الرابعة ـ ولا يوجد فيها ما في صدر الرسالة من الرقم (127) إلى آخر (141) وجاء بدلا من هذا كله:

«بسم الله الرحمن الرحيم. رب يسّر بلطفك العميم. الحمد لله واهب العقل، مفيض العلم، والصلاة على رسله، خصوصا على محمد وآله ... » .

ثم جاء الرقم (142) «ما معنى العقل بالقوة ... » إلى آخر الرقم (266) وذلك يطابق الورقة (16 ب ـ 23 آ) منها. ومن هنا كتبت المباحثة الاولى «وصل للشيخ عدة كتب ... » الرقم (1) إلى آخر الرقم (31) وذلك يطابق الورقة (23 آ ـ 25 ب) . وهنا انتقل إلى الرقم (267) إلى اخر الرقم (309) وذلك يطابق الورقة (26 آ ـ 27 ب) . ثم كتبت المباحثة الثانية، الرقم (32) «وصل كتاب الشيخ الفاضل ... » إلى آخر المباحثة، الرقم (46) . ويطابق الورقة (27 ب ـ 29 آ) . ثم يوجد الرقم (310) إلى آخر الرقم (396) ويطابق الورقة (29 آ ـ 33 ب) منها. ثم تشرع المباحثة الثالثة، الرقم (47) «وصل خطاب الشيخ الفاضل ... » إلى آخر المباحثة، الرقم (126) ويطابق الورقة (33 ب ـ 39 ب) ثم تشرع المباحثة السادسة ولا يوجد فيها ما في صدر الرسالة وتشرع بالسؤال الرقم (400) إلى آخر الرقم (787) ويطابق الورقة (39 ب ـ 67 آ) وبقية المباحثة السادسة غير موجودة فيها. وجاء في آخر الرسالة:

«هذا آخر الموجود من هذا الكتاب تم كتاب المباحثات المعروف