11 أيلول/ سبتمبر، عمليات انتحارية في نيويورك وفرجينيا. قامت طائرتان بتفجير مبنيي مركز التجارة العالمي في نيويورك، وقامت طائرة أخرى بتفجير جزء من البنتاغون، وزارة الدفاع، وسقوط طائرة رابعة في بتسلفانيا كانت متوجهة إلى البيت الأبيض الذي تم إخلاؤه. مقتل أكثر من 2800 شخص وجرح الآلاف. الرئيس بوش يعلن مسؤولية القاعدة وأسامة بن لادن. بعد ذلك، أقامت الولايات المتحدة تحالفًا دوليًا لمكافحة الإرهاب. 12 أيلول/ سبتمبر، الطالبان تدين العمليات الإرهابية في الولايات المتحدة وتدعو إلى عدم الانتقام. 14 أيلول/ سبتمبر، الرئيس الأمريكي بوش يعلن في قرار تنفيذي عن حالة ا لطورائ من أجل معالجة التهديدات الإرهابية ويجمد أموال منظمات وشخصيات إسلامية، من بينها جماعة أبو سياف، وحركة المجاهدين، والجهاد الإسلامي ا لمصري، وعصبة الأنصار، الجيش الإسلامي في عدن، ومؤسسة الرشيد. 15 أيلول/ سبتمبر، مقتل أحمد شاه مسعود، زعيم تحالف الشمال الأفغاني بعد إصابته في 9 أيلول/ سبتمبر.

20 أيلول / سبتمبر، رجال الدين في أفغانستان يطلبون من بن لادن الرحيل عن أفغانستان.

25 أيلول/ سبتمبر، بن لادن يدعو الباكستانيين لضرب القوات الصليبية، والملا عمر يهدد بإحراق أمريكا. الرئيس الأمريكي يجمد ودائع مالية لـ 27 شخصًاَ ومؤسسة إسلامية، من بينها عصبة الأنصار في لبنان. عصبة الأنصار تعلن بأنها لا تملك مؤسسات مالية. 27 أيلول/ سبتمبر، وزارة العدل الأمريكية تنشر أسماء وصورًا لـ 19 شخصًا يشتبه في أنهم نفذوا عمليات الحادي عشر من أيلول/ سبتمبر في الولايات المتحدة.