1998 صبحي الطفيلي، الأمين العام السابق لحزب الله في لبنان، توارى عن الأنظار بعد مجابهة عسكرية مع الجيش اللبناني. وفاة سعيد شعبان، زعيم حركة التوحيد الاسلامي في لبنان. كانون الثاني/ يناير، حلت المحكمة الدستورية في تركيا حزب الرفاه. كانون الثاني/ يناير، حكم على أحمد رمزي يوسف بالسجن المؤبّد في الولايات المتحدة الأمريكية. 7 آب/ أغسطس، تفجير سفارات الولايات المتحدة في نيروبي/ كينيا ودار السلام/ تانزانيا أسفر عن قتل أكثر من 263 شخصًا وجرح أكثر من خمسة آلاف. اسامة بن لادن والجهاد الإسلامي وتورّطا في التفجيرات. في 20 آب/ أغسطس انتقمت الولايات المّتحدة بهجومين صاروخيين. أكثر من 75 صاروخ كروز توماهوك أطلقت من السفن الأمريكية على موقعين: الأول، معسكر تدريب ودعم لابن لادن، وهو معسكر ظواهر كيلي البدر، ويقع على بعد 94 ميلًا في جنوب كابول وقرب الحدود مع أفغانستان وباكستان، والثاني، مركز الشفاء لصنع الأدوية، في المنطقة الشمالية الشرقية للخرطروم، السودان، الذي موّله بن لادن لإنتاج المواد الكيمياوية. اقتحام طلاب سودانيين سفارة الولايات المتحدة في الخرطوم.

1999 ليبيا تسلم المتهمين الرئيسيين في حادثة تفجير طائرة بان آم فوق لوكربي، سكوتلاندا عام 1988.

كانون الثاني/ يناير، وفاة الملك حسين في الأردن. كانون الأول/ ديسمبر، قوات الأمن الأردنية تقبض على مجموعة إرهابيين على ارتباط بأسامة بن لادن يخططون للعمل ضد أهداف غربية. محاولة جزائري إسلامي متشدد الدخول إلى الولايات المتحدة والقيام بعمل تفجيري بمناسبة الاحتفالات بالألفية الثالثة. في الهند انفصاليون من حركة المجاهدين يختطفون طائرة هندية ويتمكنون من الإفراج عن مسعود أزهر.

القرن الحادي والعشرون