المكتبة ... الرقم ... التاريخ
الظاهرية ... 387 (مجموع43) ... ق4-5هـ
خزانة القرويين ... 1/172 (169) ... ق5-6هـ تقديرًا
متحف طوبقبو سراي ... 2/13 [2205 a275] ... 546هـ
كوبريلي ... 1/235-236 (461) ... 565هـ
ألبرت الأول ... 18 (36) ... 590هـ
متحف الجزائر ... 18/108 [ (424) 183a] ... 590هـ
المحمودية (كحالة) ... 132 (75حديث) ... 608هـ
الأزهرية ... 1/627 { (445) 3572} ... 610هـ
السعيدية ... 1/176 [ (348) hadith 15] ... 617هـ
الظاهرية ... 387 (مجموع63) ... قبل618هـ
عدد مخطوطات الموطأ في مكتبات العالم (566) مخطوطا.
النسخ المطبوعة:
الناشر ... عناية أو تحقيق ... تاريخ الطباعة
دهلي ... 1216هـ
دهلي: المطبع المجتبائي - رواية محمد بن الحسن ومعه التعليق الممجد ... أبو الحسنات اللكنوي ... 1306هـ
لاهور ... 1307هـ
فاس ... 1310هـ
دهلي: المطبع العلوي ... 1310هـ
فاس ... 1318هـ
القاهرة: مطبعة الحلبي بآخره إسعاف المبطأ برجال الموطأ للسيوطي ... 1349هـ
القاهرة: مطبعة عيسى الحلبي ... محمد فؤاد عبد الباقي ... 1370هـ
القاهرة: دار إحياء الكتب العربية ... محمد فؤاد عبد الباقي ... 1371هـ
القاهرة: المجلس الأعلى للشؤون الإسلامية ... عبد الوهاب عبد اللطيف ... 1382هـ
بيروت: دار النفائس ... أحمد راتب عرموش ... 1391هـ
تونس: الدار التونسية للنشر - رواية عبد الله بن مسلمة القعنبي ... عبد الحفيظ منصور ... 1396هـ
بيروت: دار الغرب الإسلامي ... محمد الشاذلي النيفر ... 1401هـ
جدة: دار الشروق - رواية عبد الرحمن القاسم ... محمد بن علوي المالكي ... 1408هـ