وجاء المبحث الثاني ليتناول الوسائل القمعية التي استخدمتها قوات الاحتلال لإحداث الإعاقة في صفوف الفلسطينيين ، وخاصة انتهاج سياسة الضرب وتكسير العظام ، واطلاق الغاز المسيل للدموع .
وجاء الفصل الثالث تحت عنوان: انتهاك الحق في الحرية ، وتناول المبحث الأول: سياسة الاعتقالات الجماعية ، وما يتعلق بها من حيث أهداف حملات الاعتقالات الجماعية، وطرق وآليات الاعتقال المتبعة، وإحصائيات المعتقلين خلال الانتفاضة، وأساليب التعذيب في أقبية التحقيق، والظروف المعيشية داخل المعتقلات، والمحاكمات العسكرية و الاعتقال الإداري .
فيما جاء المبحث الثاني ليتحدث عن سياسة النفي والإبعاد ، متناولا أهداف إسرائيل من سياسة الإبعاد ، وإحصائيات المبعدين ، وإجراءات تطبيق عقوبة الإبعاد ، والموقف الدولي من سياسة الإبعاد ، إضافة إلى دراسة حالة مبعدي مرج الزهور .
وجاء الفصل الرابع تحت عنوان: انتهاك الحق في التنقل والحركة ، متناولا المبحث الأول منه الحديث عن فرض سياسة الإغلاق ، من حيث ممارسة سياسة الإغلاق خلال الانتفاضة ، وأهداف إسرائيل من فرض الإغلاق ، وأشكال الإغلاقات في قطاع غزة ، إضافة إلى الآثار المترتبة على الإغلاق .
وجاء المبحث الثاني للحديث عن فرض نظام حظر التجوال ، الذي اتبع للرد على تصاعد الانتفاضة ، وما رمى إليه من أهداف ، إضافة للحديث عن ظروف حظر التجوال وآثار على السكان .
وجاء الفصل الخامس والأخير تحت عنوان: انتهاك الحق في حرية التعبير عن الرأي ، حيث تناول المبحث الأول قضية انتهاك حرية التعبير في وسائل الإعلام ، من حيث دور وسائل الإعلام في الانتفاضة ، والممارسات ضد الصحف ووسائل الإعلام ، وإغلاق قطاع غزة في وجه وسائل الإعلام .